协助局长分管办公室、规划财务科、综合管理科、自然生态保护科、市环境应急监控指挥中心（市环境信息中心）、机关党总支（党风廉政建设和反腐败工作、纪检监察工作、包括工、青、妇及老干部工作）、扶贫工作。

　　党组成员、副局长叶苞九：协助局长分管政策法规宣教科、污染防治科、科技产业科、市固体废物管理中心、市机动车排气污染防治监督管理中心（市大气环境管理中心）、市污染总量控制办公室（中央环保督察整改办）、市环保局章贡分局、市环保局经济技术开发区分局、蓉江分局、市环境监察支队、市辐射环境监督站。

　　市环境监测站站长刘辉：负责市环境监测站工作；协助局长分管行政审批科、环境监测科、市环境科学研究所、市环境评估中心，负责污染源普查工作。